La infección por el nuevo coronavirus SARS-Cov 2 afecta de manera significativa al sistema respiratorio, aunque no deja de tener repercusión sobre otros órganos, aparatos y sistemas de la economía. En el caso específico del sistema digestivo, se ha podido determinar la replicación del virus en células de algunos de sus órganos, elemento este que influye en la aparición de síntomas en los pacientes infectados o modificaciones en la analítica relacionada. Algunos de los fármacos utilizados en el tratamiento se acompañan de manifestaciones digestivas como efectos no deseados. La presencia del virus en la mucosa nasofaríngea hace que los procedimientos endoscópicos sobre el tracto digestivo superior sean altamente riesgosos, lo que ha impuesto necesariamente cambios en los sistemas de trabajo de las unidades de endoscopía.  Finalmente, existe un grupo de pacientes con enfermedades intestinales y hepáticas cuyo mecanismo patogénico o su tratamiento está relacionado con la inmunosupresión, por lo que requieren de una atención especializada y particularizada. En esta revisión se aportarán los conocimientos hasta ahora establecidos sobre estos aspectos, de modo tal que sirva a los profesionales relacionados con el diagnóstico y tratamiento de las enfermedades digestivas.